作为互联网医疗领域的知名人士，吴亚军在健康管理领域着重发力。吴亚军认为，健康管理指管理个体的健康，维护个体的健康状态，并帮助个体保持优质健康状态。
吴亚军认为，个人生命方式与健康息息相关，而健康管理需要其本身的实时性，便捷性与参数化等，这恰恰是互联网平台的优势所在。结合健康数据的收集，大数据分析与挖掘，以及人工智能等新型技术的应用，可以更好地实现健康管理的全方位覆盖和个性化运营。
除此之外，在古代医学，医生不仅救治病人，还要讲求预防。吴亚军认为，现代医学也应该注重健康干预，而且不只是针对疾病，更要讲求人的全面健康。因此，相较于传统医生的角色，健康管理师的角色更加广泛，需要熟悉现代医学理论，同时也需要了解健康教育的知识与方法，甚至需掌握干预技能。